Fazem parte da Secretaria de Administração as coordenadorias de Material e Patrimônio, Serviços Gerais e Gerenciamento de Documentos, além da Seção de Análise e Planejamento. A Seção de Análise e Planejamento atua assessorando o secretário e interagindo com as coordenadorias e suas seções na realização das atividades da secretaria.

A Coordenadoria de Material e Patrimônio é composta pelas seções de Compras, Licitações e Contratos e de Administração de Material e Patrimônio. A Seção de Compras, entre outras atividades, pesquisa e faz aquisição direta por Registro de Preços, promove a distribuição e controle da entrega de notas de empenho às pessoas físicas e/ou jurídicas vencedoras das licitações e contratadas diretamente.

A Seção de Licitações, por sua vez, publica os editais e contratos firmados entre o TRE-BA e empresas, bem como as instruções processuais para a fiscalização dos contratos. A Seção de Administração de Material e Patrimônio elabora as propostas orçamentárias para alocação de recursos destinados à aquisição e conservação de material para os respectivos exercícios financeiros.

A Coordenadoria de Serviços Gerais é formada pelas seções de Manutenção Predial, Serviços Gerais, Transporte e Manutenção de Veículos e Processamento Documental. As atividades da Seção de Manutenção Predial são relativas ao Projeto TRE Perto de Você, ao alistamento e todas as demais ações do período eleitoral.

A Seção de Serviços Gerais realiza todos os serviços oferecidos pelo TRE e fiscaliza a execução dos contratos de concessões. Enquanto a Seção de Transporte e Manutenção de Veículos mantém a frota de veículos e controla os deslocamentos a serviço do TRE.

A Coordenadoria de Gerenciamento de Documentos é formada pelas seções de Expedição, Protocolo e Processamento Documental e se responsabiliza por toda movimentação de documentos, a exemplo de processos e inquéritos, publicações e correspondências do TRE. Além disso, faz treinamento de servidores em Salvador e no interior do estado.